計算機共同利用
SERVICE
SHIROKANE + SHIRAUME
SHIROKANEは東京大学医科学研究所に設置されているライフサイエンス分野専用のスーパーコンピュータであり、専用コンピュータとしては国内最大の演算性能を持ちます。演算性能は合計で 1,250TFLOPS以上、ストレージ容量は約30PB、そのほかにもデータ長期保存用のアーカイブディスクやGPUサーバーなど昨今の生命科学研究に必要不可欠である計算資源を備えています。学術・民間機関向けにサービスを提供しており、多くの生命科学者が共同で利用しています。
SHIRAUMEは2021年3月より東京科学大学（旧東京医科歯科大学）で稼働している、大規模生命・医療データ格納向けに設置されたオブジェクトストレージサーバーです。総容量は2.5PBであり、全ゲノムデータなどのアラインメントなどを実行させることのできる計算機サーバーも備えています。大学内ネットワークにおいてセキュアに運営されており、SHIROKANEとSHIRAUMEはデータの直接的な送受信が可能なため、全ゲノムデータなどの大規模データをSHIRAUME内で管理しつつ、必要に応じてSHIROKANEに転送し、解析を行うことが可能です。
M&Dデータ科学センターでは上述のSHIROKANEの利用に関する包括契約を締結しました。本契約の締結に伴い、大規模計算リソースを安価に利用することが可能です。これに合わせて学内ストレージサーバーであるSHIRAUMEを連携させることにより、大規模生命・医療データの計算・格納資源を十分に提供することが可能です。
興味のある方はぜひ
SHIROKANE＆SHIRAUME サポート係（dsc_support@@ml.tmd.ac.jp)
までお問い合わせください。
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活用例
▲活用例１：SHIRAUME上のストレージをマウントしてSHIROKANEで解析
▲活用例２：大容量メモリと高性能GPUを活用した大規模解析の実施
▲活用例３：SHIRAUMEを学内クラウドストレージとして活用
興味のある方はぜひ
SHIROKANE＆SHIRAUME サポート係（dsc_support@@ml.tmd.ac.jp)
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利用方法
ストレージサーバーSHIRAUME
- 利用内規
- プライバシーポリシー
- 利用料金:1グループ1TiBあたり500円/月(最低8TiB)
- 利用申請書及びアカウント申請書に記入の上、上記メールアドレスまで送付をお願いいたします。
- SHIRAUME 利用マニュアル（学内専用)
※アカウントの新規発行・利用量の設定変更・アカウントの停止には
通常１〜２週間程度要します。
各月1日付で新規・変更・停止とする場合、前月の20日までに申請してください。
※学外者の利用も利用内規に準じます。
本サービスを利用して得られた成果を発表する場合は、文中や謝辞にて本サービスを利用したことを明記してください。以下に記載例を挙げます。
SHIROKANE
- 本研究は、東京科学大学総合研究院M&Dデータ科学センターが提供する、東京大学ヒトゲノム解析センター・スーパーコンピュータ SHIROKANE 利用サービスを使用しました。
- The super-computing resource was provided by Human Genome Center (the Univ. of Tokyo), through the usage service provided by M&D Data Science Center, Institute of Integrated Research, Institute of Science Tokyo.
SHIRAUME
- 本研究は、東京科学大学総合研究院M&Dデータ科学センターの大規模ストーレージサーバを使用しました。
- The large-scale storage system was provided by M&D Data Science Center,Institute of Integrated Research, Institute of Science Tokyo.
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